１４日午後９時２６分ごろ、熊本県を震源とする地震があり、同県益城町で震度７の揺れを観測した。気象庁によると、震源の深さは約１１キロ（暫定値）、地震の規模（マグニチュード）は６．５（暫定値）と推定される。この地震による津波の心配はないという。震度７の揺れが記録されたのは２０１１年３月の東日本大震災以来。熊本県などによると、益城町で２人が死亡、１人が心肺停止状態。約１００人が負傷し、多数の家屋が倒壊しているもようだ。
気象庁は、地震のメカニズムについて、南北方向に引っ張られる「横ずれ断層型」と説明した。この地方では一般的なメカニズムとしている。
１５日午前０時すぎには、熊本県で震度６強の揺れを観測するなど震度３以上の余震が二十数回発生した。気象庁は今後も１週間程度、余震が続く可能性があるとして、警戒を呼び掛けた。熊本県知事は陸上自衛隊に災害派遣を要請した。
熊本県警などによると、益城町で死亡した２人のうち１人は倒壊した家屋の下敷きなり、１人が火事で亡くなった。このほか、女性１人ががれきの下敷きになり、意識不明の重体。また、４人が生き埋めになり、全員が救出されたが負傷の程度は不明。警察庁によると、益城町に被害が集中。熊本県内の１１０番は５９０件に上った。
政府は首相官邸の危機管理センターに官邸対策室を設置し、情報収集を進めている。菅義偉官房長官は緊急の記者会見し「被害状況の全容把握に努めている。複数の家屋が倒壊しているとの情報がある。原子力施設については被害の情報は入っていない」と述べた。
九州電力によると、佐賀県の玄海原発に異常はない。鹿児島県の川内原発は運転を続けている。
九州新幹線は博多―鹿児島中央間の全線で運転を見合わせた。国土交通省によると、ＪＲ熊本駅から熊本市内の車両基地に向けて回送中の九州新幹線８００系（６両編成）が脱線した。乗客は乗っておらず、運転士にけがはなかった。全車両が脱線して復旧の見込みは立っていないという。
九州電力によると、熊本県内で約１万６７００戸が停電している。約３万８０００戸でガスの供給が止まっているという。
主な各地の震度は次の通り。
震度７＝熊本県益城町
震度６弱＝熊本市、熊本県玉名市、宇城市、西原村
震度５強＝熊本県菊池市
震度５弱＝宮崎県椎葉村。