熊本県を中心に相次いだ地震で、同県南阿蘇村などは１８日、行方不明者が２人増え９人になったと発表した。いずれも１６日未明に発生したマグニチュード７．３の本震で被害に遭ったとみられる。負傷者の生存率が急激に低下するとされる発生から７２時間が迫る中、自衛隊や警察などは約４０００人態勢で捜索・救出活動を続けるが、大量の土砂に阻まれ難航している。１４日以降の地震で、県内ではこれまで４２人の死亡が確認された。
捜索は、土砂崩れが起き６人と連絡が取れない同村の河陽地区と、宿泊施設「火の鳥」で４０代の男女２人が行方不明になっている長野地区を中心に実施。河陽地区では、道路を広げるなどして新たに重機を使えるようになった。村によると、不明者は男性５人、女性３人、性別不明１人。
熊本県によると、１８日午前９時現在で、６００を超える避難所に約１０万５０００人が避難。道路が寸断されるなど交通事情が悪く、支援物資が十分に行き渡らない所もあり、病人や高齢者など災害弱者の心身のケアも課題となる。
熊本県内で判明している家屋被害は全壊約４００棟、半壊約１２００棟。被害の大きい益城町や南阿蘇村などは調査できておらず、損壊棟数は大幅に増える見通し。
ＪＲ九州は脱線した九州新幹線の回送列車の撤去を１８日から始める予定だが、施設の破損やレールのゆがみが新たに見つかっており、運転再開の見通しは立っていない。
在日米軍は１８日以降、普天間飛行場（沖縄県宜野湾市）の海兵隊所属の垂直離着陸輸送機ＭＶ２２オスプレイで、岩国基地から被災地へ水や食料、毛布などの救援物資を空輸する。